MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 plasmid pHPB14

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017734	CGCTT	2	10	35	44	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017734	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017734	T	6	6	152	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017734	ATT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017734	T	6	6	212	217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017734	GTTG	2	8	225	232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017734	TGGT	2	8	287	294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017734	GT	3	6	293	298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017734	T	6	6	330	335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017734	CTT	2	6	347	352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017734	T	6	6	398	403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017734	GTTT	2	8	425	432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017734	T	6	6	489	494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017734	TCT	2	6	532	537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017734	TTAG	2	8	927	934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017734	TTA	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017734	ACT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017734	CCT	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017734	TAA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017734	AAG	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017734	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017734	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017734	AAG	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017734	AAG	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017734	A	6	6	3807	3812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017734	CG	4	8	3865	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017734	A	6	6	3891	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017734	AAACAA	2	12	3919	3930	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017734	CGCTT	2	10	4091	4100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017734	CGCTT	2	10	4157	4166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017734	GTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017734	T	6	6	4274	4279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017734	ATT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017734	T	6	6	4334	4339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017734	GTTG	2	8	4347	4354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017734	TGGT	2	8	4409	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017734	GT	3	6	4415	4420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017734	T	6	6	4452	4457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017734	CTT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017734	T	6	6	4520	4525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017734	GTTT	2	8	4547	4554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017734	T	6	6	4611	4616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017734	TCT	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017734	TTAG	2	8	5049	5056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017734	TAA	2	6	7490	7495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017734	CCT	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017734	CT	3	6	7651	7656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017734	TCC	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017734	CAAGT	2	10	7680	7689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017734	TAT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017734	ACA	2	6	7828	7833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017734	GA	3	6	7871	7876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017734	T	6	6	7877	7882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017734	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017734	AAG	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017734	AAG	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017734	AAG	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017734	A	6	6	7989	7994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017734	CG	4	8	8047	8054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017734	A	6	6	8073	8078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017734	AAACAA	2	12	8101	8112	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017734	CGCTT	2	10	8273	8282	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.